正式名称は、真宗大谷派福井別院本瑞寺。
（しんしゅうおおたには・ふくいべついん・ほんずいじ）

地元福井では東別院、福井東別院とよばれています。
「真宗大谷派」の別院で、教えは親鸞聖人を宗祖とする「浄土真宗」、本山は京都市にある真宗本廟（東本願寺）です。

越前における親鸞聖人の教えの普及は承元元年（1207）の越後御流罪、北陸路を通過される頃から始まったと考えられ、念仏の道場はそのころより創設されたと推測されています。

蓮如上人（本願寺八代）が吉崎に向かわれた際（1471）の布教を契機に、多くの寺院が蓮如の本願寺に改宗・転派あるいは創建し、末寺となりました。この北ノ庄（現在の福井市）にも教化を受けた人々によって総坊（総道場）が建てられました。それは浜町（現在の中央三丁目。足羽川沿いのうち九十九橋から桜橋）近くで、近隣の九ヶ寺で管理するようになりました。

慶長6年（1601）徳川家康の二男である結城秀康が初代藩主として入部しました。教如上人（本願寺十二代）を徳川家康が肩入れする関係にあったこともあり、秀康は教如上人に好意的な立場でした。慶長10年（1605）には秀康から城下の常盤町に約三千坪の寺地を寄進され、堂宇を建立しました。このときから「東之御坊本瑞寺」と称するようになりました。十四間四面の本堂と、三間に五間の庫裡でした。ここに名実共に「東御坊」が誕生したのです。さらに、総坊監理の九ヶ寺も本瑞寺寺域内に移され、北ノ庄における教如上人への支持はこうして固まっていきました。

慶長15年（1610）初代住職には教如上人の三女・亀子姫（栄寿院教応禅尼）が就きました。その時、亀子姫は十七歳でした。

このあと寛永年間末期（～1644）第三代住職従応（龍華院宣亨）の時にこの堂宇は大火で焼失してしまいます。これが福井別院の第一回の火難でした。

現在の本堂（鉄筋コンクリート造）は、昭和38年（1963）6月の宗祖親鸞聖人700回御遠忌のとき、本堂再建を計画し、同44年5月に完成したものです。
平成15年（2003）5月22～25日には蓮如上人500回御遠忌を、福井教区と福井別院が教別一体となってつとめました。その記念行事として、大谷会館とともに本堂（19間×25間）を修復しました。

あなたは本尊に向かい、どのような思いで手を合わせておられるでしょうか？
ご本尊は、私の思い通りにしたいことをかなえてくれる存在ではなく、私たちに「あなたにとって本当に尊いことはなんですか？」と問いかけてくださる仏様なのです。
浄土真宗のご本尊は阿弥陀如来です。そのお姿は絵像、木像などがありますが、どれも「南無阿弥陀仏」の六字名号を私たちに分かりやすく表現したものであります。
親鸞聖人は、「南無阿弥陀仏」あるいは「帰命盡十方無碍光如来」をご本尊として礼拝されていたともいわれています。
ご本尊に向かって右脇に掛けられています「帰命尽盡十方無碍光如来」（十字名号）、左脇に掛けられています「南無不可思議光如来」（九字名号）は阿弥陀如来の私たちへ呼びかける願いのちがいによって呼び名が変わりますが、どちらも「南無阿弥陀仏」の別の呼び方であります。（脇掛けは「親鸞聖人」「蓮如上人」の絵像の場合もあります。）
阿弥陀如来は生きとし生けるものをわけへだてなく救おうとしてくださる仏像です。立ち上がって私たちに寄り添おうとしてくださるお姿が、浄土真宗のご本尊なのです。
私たちは、その阿弥陀如来の願いに尊いと気づいたとき、自然と「南無阿弥陀仏」と手が合わせるのです。

浄土真宗の教えを顕かにされた親鸞聖人。私たち真宗門徒は「宗祖」・「御開山」（ごかいさん）と呼び親しんでいます。親鸞聖人は『顕浄土真実教行証文類（けんじょうどしんじつきょうぎょうしょうもんるい）』（『教行信証』）を著し、念仏の教えを伝え広められました。
9歳のときに出家、得度をし、20年の間比叡山で仏教を学ばれましたが、生きることの真実の意味を求め比叡山を降りられます。そして、「東山吉水」の法然上人のもとにゆかれ、「ただ念仏して、弥陀にたすけられまいらすべし」という仰せに出遇われ、すべての人がともに救われる念仏の教えを明らかにしてくださいました。